조 전 장관은 취임 직후인 지난해 9월 통해 검찰 직접수사 축소, 형사·공판부 강화 및 우대 등 검찰제도 개선 방안을 수립하라는 내용을 포함한 '2호 지시'를 내린 바 있다. 이는 '1호 지시'로 수립된 검찰개혁추진지원단의 주요 개혁 과제이기도 했다.
2기 법무·검찰 개혁위원회(개혁위)의 1호 권고안 역시 같은 취지로 인사·조직 관련 규정을 개편하는 작업에 착수하도록 하는 내용을 담았다.
이어 법무부는 지난해 11월 전국 검찰청 직접수사부서 45곳 중 서울중앙지검 반부패수사 1~2부와 대구지검 반부패수사부, 광주지검 반부패수사부 등 4곳을 제외한 41곳을 폐지하는 내용의 검찰 직제 개편 방안을 문재인 대통령에게 보고했다.
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