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이명박 정부 시절 국가정보원이 '친일인명사전' 발간을 주도한 민족문제연구소와 임헌영 소장을 비판하는 사이버 심리전을 벌인 사실이 파악됐다. 특히 이같은 공작에는 원세훈 전 원장이 직접 관여한 것으로 밝혀졌다.
인터넷 포털사이트 다음의 토론게시판 '아고라'도 활용됐다. '친일사전 발간이 노리는 불순한 목적', '제멋대로인사전을 믿을 수 있나' 등 요지의 토론글을 게재하거나 <조선일보>, <동아일보>의 비판 사설을 퍼 날랐다.
이명박 정권이 '친일 과거사 청산' 작업에 대한 방해 공작을 편 정확한 이유는 알 수 없다. '박정희 우상화' 작업 등이 이명박, 박근혜 정권 내내 진행됐던 점에 비춰보면, '친일 과거사 청산'이 그같은 '우상화'에 방해된다고 생각했을 개연성도 없지 않다.